遗传学的一个分支学科。主要研究基因如何控制生物胚胎发育的问题。从遗传的观点看，生物的发育就是由基因型逐渐转变为表现型的过程。基因控制发育的特点是有时序性和空间性。从受精卵开始，经过细胞决定、胚层分化到组织、器官的形成，每一步基因的表达都是严格有序的，并且体现出一定的空间结构。在这过程中，如果基因发生突变，就会造成相应阶段发育的异常、停顿，甚至胚胎的死亡。发生遗传学的研究方法，主要是利用影响发育的突变型与正常的发育型进行比较，并结合实验胚胎学、细胞生物学和分子生物学的方法技术，从不同水平分析基因和性状发育的关系，以阐明基因控制发育的机理。常用的实验材料是黑腹果蝇和小鼠。60年代英国科学家布伦纳（S.Brenner）提倡用雅致隐杆线虫（Caenorhabditiselegans）来研究发生遗传学和行为遗传学问题，已取得某些进展。