有机化合物分子结构中能反映化学特性的原子或原子团叫官能团。官能团能决定有机物的主要化学性质。具有相同官能团的有机物，化学性质类似。重要官能团有双键、三键（—C≡C—）、卤素（—X）、羟基（—OH）、巯基（—SH）、羰基、醛基、羧基（—COOH）、硝基（—NO₂）、氨基（—NH₂）、氰基（—CN）、磺基（—SO₃H）等。官能团是有机物分类的重要依据之一。在有机合成中往往把引入或消除的官能团作为该反应的名称，如烷基化反应、脱羧（基）反应等。