（1）是产生大孢子的囊状生殖器官。卷柏属的大孢子囊是由大孢子叶基部内侧包有双层的壁细胞的表皮细胞产生的，其中有4个大孢子。在水生蕨类，是由大孢子囊果中的包有一层壁细胞形成的孢子囊，其中生有32个大孢子，除其中一个以外，其他已全部退化。退化的孢子与沿着壁细胞形成一层毡绒层的细胞质，液泡化后成为大孢子的周壁；（2）种子植物，特别是裸子植物的胚珠，由于保留有与蕨类大孢子相同的胚囊细胞，所以亦称为大孢子囊。