真菌和植物作为无性生殖的方式所形成的生殖细胞。它和配子不同，能单独形成新的个体（世代）。形成孢子并进行生殖的世代称作孢子体。各分类群各有其独特的生活史，因此无性孢子的繁殖方法也多种多样，不同的类群每有其特殊的孢子形态、大小、形成部位和形成方式，而同一种类也常产生各种各样的孢子，并各有其特定的名称。孢子有真孢子和营养孢子，前者是由特定的二倍体（2n）细胞通过减数分裂形成的，其核相为单倍的（n）；后者则与此相反，是身体的一部分直接通过分裂产生的（真菌的厚垣孢子，分生抱子，锈菌的冬孢子，锈孢子等）。如果孢子在孢子囊中形成，称为内生孢子；如果是在体外游离的小细胞具有孢子的特性，则称为外生孢子。如果同一个体所形成的孢子形态相同，称为同形孢子；如有大小二种形态，则称为异形孢子。孢子一般是单细胞，但在半知菌等类中，也有多隔的多细胞孢子；在菌丝顶端生出的为顶生孢子。从孢子外形上看，可分为节孢子、芽状孢子、丝状孢子、原始孢子、柄生孢子、网状孢子、星状孢子、卷曲状孢子以及干孢子、粘孢子等；还有无色透明的无色孢子、褐色和黑色的暗色孢子。蕨类植物的孢子在12℃以下多不能发芽，多数孢子发芽的最适温度是25—30℃；红色链孢霉的子囊孢子，发芽需要高温，所以有的在火灾之后发芽生长。一般除真菌的孢子外，其他孢子在完全黑暗的环境中不能或很难发芽。某些寄生真菌如果不侵入一定的寄主体内，便不能发芽（如锈菌、黑穗菌）。孢子发芽的方式有时也是分类学上的特征，这在蕨类植物的瓶尔小草目（Ophioglossales）、紫萁科（Osmund－aceae）、金鸡脚假茀蕨（Polypodium hastaum，Phymatopsis hastata）等三类植物中是很明显的。原垣孢子及苔藓和蕨类的孢子具有很厚的外壁，寿命很长，有的过1年以后仍能发芽。红藻的果孢和四分孢子在放出体外12—24小时内即可发芽。所以孢子期极短。在真菌中，冬孢子等可以越冬，其生存期在1年以上，厚垣孢子有的可活数年，但水生真菌的游动孢子和青霉菌的分生孢子寿命很短。