在这一部分里，涉及到我们日常使用的常规的化学物质、不留意间释放的工业或生活污染物以及天然存在的毒性物质。包括农药残留、兽药残留、食品添加剂、饲料添加剂、其它来源化学污染物以及天然毒素。

风险评估可以被视为系统地组织科学和技术信息的一种最基本的方法，以及与之相关的不确定性，都可以用来回答有关健康风险的一系列问题，提出解决国际贸易技术争端的一些可行性方案。这要求评估相关信息，以及从那些信息中提取相关参数选择相应模型。而且，要精确的考虑对于数据的收集以及知识运用的不确定性，以排除科学的似是而非性。

风险评估受数据和模型选择的不确定性的支配。不确定度我们将在后面的章节中进一步讨论。但在这里需要指出的是数据的不确定性同时来源于可用数据的有限性，以及对从流行病学和毒理学获得数据的正确的评估和解释。无论何时当我们试图用数字描述某种条件下发生的某种现象时，就要用一些已知的条件推测来估计或预测那些不能获得数据的有可能发生的现象，这就产生了模型的不确定性。

风险评估的过程中需要足够的毒理学信息，而且这些信息要基于标准测试协议，并被国际组织接受。此外，一份可靠的风险评估要求要有已经被国际组织如：JECFA，JMPR，EPA，FDA，OECD 认可的数据，并且这些数据的量必须高于某一限值。

对于化学危害物而言，以经验为基础的毒理学解释，作为风险评估是可行的。然而，到目前还没有足够复杂的科学信息可以提供一个非常高的确定度。当这里有许多动物毒理学数据可以使用，但是却没有足够的数据可以最可能的预测人类的反应（如种、属、毒性作用靶位）。结果，依靠在研究过程中可接受的最低剂量的毒性反应，就慢慢形成一种传统。

风险评估所需要的最小量数据很难预先列出清单，以物质为基础的危害数据、剂量-反应数据和暴露评估数据都会在很大程度上支配风险评估的范围、规模和质量。在许多情况下，数据非常有限或者根本就不可能获得。后者尤其适用于天然污染物和自然界存在物质的情况。当需要进行一项风险评估时，风险评估者就要对所需要的所有的信息进行最好的应用。并准确处理数据的不确定性。在某些得不到数据或其它不可能的情况下，风险评估者应当提供做出这种判断的原因。一个正确的选择将使问题在很少数据量下就得到解决。

风险评估过程中的其它事项包括使用默认设想来弥补知识和数据的缺乏。这将为确保不断的进行风险评估并减少评估过程中的事事控制，以达到风险管理目标的预决定提供很大益处。然而，一个重要的不利因素就是由固有的条款代替科学判断的潜在危害。一个折中的做法就是允许风险评估者在具体的化学评估中可以替换默认值，这样做必须有可利用的相关科学数据支持。