第一类，植物性转基因食品。这类食品比较多。如，面包生产需要高蛋白质含量的小麦，而目前小麦品种含高蛋白质较低，将高效的蛋白基因转入小麦，将会使做成的面包具有更好的烘烤性能。 　　第二类，动物性转基因食品。如在猪的基因组中转入人的生长素基因，猪的生长速度增加了一倍，猪肉质量大大提高，现在这样的猪肉已在澳大利亚被批准登上餐桌。
　　第三类，转基因微生物食品。如生产奶酪的凝乳酶，以往只能从杀死的小牛的胃中才能取出，现在利用转基因微生物已能够使凝乳酶在体外大量产生，避免了小牛的无辜死亡，也降低了生产成本。
　　第四类，转基因特殊食品。如科学家利用生物遗传工程，将普通的蔬菜、水果、粮食等农作物，变成能预防疾病的神奇的“疫苗食品”