该模型认为：同源染色体在联会期间，一对同源染色体各有一条单链DNA断裂，然后要发生重接，不过在重接的过程中发生了错误，不是原来断开的染色体重新连接起来而是交换连接，并且要通过一种Holliday 中间结构的变化最后形成不同类型的重组体。在此过程中需要特殊的DNA重组蛋白：RecA 蛋白。这一模型是Holliday提出的，所以又称为Holliday重组模型。