卡氏肺孢子虫感染严重时引起的机会性卡氏肺孢子虫肺炎多发生在早产儿，营养不良的婴儿和免疫受抑制的儿童和成人。
临床表现
　　1.干咳、气促、呼吸困难和紫绀。 2.发热或无热。 3.纳差，偶有腹泻，体重减轻。 4.双肺偶闻及少许罗音。 5.幼儿可发生纵隔气肿和皮下气肿。 6.部分成人患者可有肝、脾肿大。
诊断依据
　　1.多见于免疫缺陷或激素、免疫抑制药物治疗后的患者。 2.早期有发热、干咳、气短，晚期常有严重呼吸困难、紫绀、进行性低氧血症、呼吸衰竭，肺部体征可听到散在的干性和湿性罗音。 3.胸部Ｘ线检查：早期呈粟粒状或网状、结节状的间质性炎症，以肺门周围浸润为主，向肺的外周播散，继而出现肺泡性炎症改变，病变广泛而呈向心性分布，与肺水肿相仿。 4.痰液、气管内抽吸物、支气管肺泡灌洗液或肺活检标本，找到卡氏肺孢子虫的包囊或滋养体为确诊依据。 5.卡氏肺孢子虫补体结合试验呈阳性反应有助诊断。
治疗原则
　　1.病原治疗。 2.支持对症治疗。 3.防止并发症。
用药原则
　　1.用“Ａ”项药物治疗缺氧严重可用面罩吸氧或机械通气。 2.加强护理和并发症的治疗，体质极弱者可选“Ｃ”项药物治疗。
辅助检查
　　1.以检查框限“Ａ”为主； 2.病情严重或诊断有困难者，检查框限可包括“Ａ”、“Ｂ”、“Ｃ”。
疗效评价
　　1.治愈：症状消失，Ｘ线检查肺部病变吸收，经痰、气管内吸取物等两种以上方法未找到卡氏肺孢子虫（治疗前检查阳性者必须复查并转为阴性）。 2.好转：症状减轻或消失，Ｘ线检查肺部病变有好转。 3.未愈：症状未改善，Ｘ线检查肺部病变未见好转。