果树腐烂病发生的周期变化，始于每年的夏季。从6月上中旬开始，病部树皮逐渐形成鳞片状的自然落皮层，进入7月以上，中旬落皮层组织又逐渐变色死亡。夏季是苹果树生长旺盛期，不是腐烂病扩展浸染的有利时机，但是这种落皮层为病原菌提供了良好的入侵条件，侵入树皮的病菌先在这里安家落户，不断入侵扩展，致使落皮层发生病变，形成表层的溃疡斑。自到11月上旬气温下降，果树进入休眠期，生活力减弱，病菌的活力才加强，侵入健康的皮下组织，形成多个坏死点，进入深冬后，病菌扩展减慢，到次年2-3月外现症状最明显，到5月发病盛期才结束。

夏季防治腐烂病，主要措施有二：一是重刮皮，刮除树体上的病斑和潜藏的病菌，以7月底以前最好。刮皮时，选用锋利的刮刀将病变树皮利去，深度约1毫米，以露出白绿或黄白色皮层为止。病斑严重的刮至木质部，切记刮治时同时要刮去病斑外围1厘米左右的好皮；刮皮后，用4％绿盾农抗120或菌杀特2号（9281）3-6信液涂刷，待药干后，用封剪油全面涂抹伤面，效果最为理想。二是喷施铲除剂。重病果园或重病果树。在夏季（6-7月）落皮层开始产生时，对主干、主枝、大枝中下部和大改形去枝伤口处喷施具有渗透性。残效期长的杀菌剂，如菌杀特2号，绿盾枝腐清、菌毒清、腐必清等，连喷2-3次，间隔7-10天。也可用上述杀菌剂30-50倍浓抹2-3次，涂抹面要大。