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一、黄瓜育苗期的死苗多是由于感染了猝倒病和立枯病所致，这两种病害为土传病害，可通过浇水、施肥等传播，防治上述病害可从以下三方面进行防治：
1、选用抗病品种，不同的黄瓜品种，其抗病性不一样，在选用品种时，除了要考虑产量和经济效益外，还应该作对比，选用抗病品种。这样能在一定程度上减少病害的发生，可以减少投入成本，间接提高效益。
2、全方面的进行消毒杀菌，一是做好种子消毒工作，在播种前，可用温汤浸种法(50～55摄氏度的水中浸泡20～30分钟)或使用药剂浸种的方法(25%的甲霜灵800倍液浸种半小时)，上述两种方法都可以有效的防治黄瓜苗期病害，二是做好苗床土壤消毒工作，可使用恶霉灵、苗菌敌、普力克等药剂处理土壤，消灭土壤中病菌。
3、发现病株以后及时处理，黄瓜幼苗发病以发病植株为中心，向四周扩展，故在发现病株以后应及时拔出带出棚外，并对植株处进行药剂处理。常用药剂有72.2%普力克600～800倍，75%百菌清600倍、58%甲霜灵锰锌500～600倍液进行喷雾或灌根。
二、造成黄瓜定植后死棵的原因很多，有拟茎点霉根腐病、蔓枯病、菌核病等导致的死棵，也有因肥水不当引起的死棵，还有因为久阴骤晴导致的死棵。在生产中应具体情况具体分析，根据不同原因采取不同的措施。
1、及时防治病害，防治拟茎点霉根腐病的药剂可选用10%世高2000倍进行喷淋，或改黑籽南瓜嫁接为白籽南瓜嫁接，有一定的效果。防治蔓枯病可选用蔓枯灵或百菌清调成糊状涂抹病处，同时结合使用百菌清600倍进行叶面喷施。菌核病可选用50%速克灵1000～1500倍进行喷雾防治。
2、合理浇水施肥，浇水要在晴天进行，并且要保证在浇水以后有3～4个晴天。浇水量不宜过大，因为浇水会降低地温，水量越大对地温影响越大，因此应采取膜下浇水或浇小水的方法，防止地温过低对黄瓜植株产生不利影响。
冬季气温较低，冲肥时应注意使用生物菌肥或腐殖酸肥为主，以利于促进根系生长，但使用要适量。
3、久阴骤晴时注意揭花帘，或在植株上喷施丰收一号1200倍，防止骤晴后造成急性萎蔫死棵。
