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从春季开始投苗至秋季，历经四五个月的养殖池塘底质随养殖时间的延伸而不断老化，饲料等有机物培育出大量的微生物（包括害虫和病菌），秋季适温的天气再加上质变的环境，池塘往往变成病虫害繁殖的温床，直接对鱼类形成威胁。秋季早晚温差较大，池塘水体容易因上下分层而缺氧。池鱼规格逐渐长大、单位容量增加，均会造成池塘鱼类病害增加。
环境、病原和鱼体三因素相互作用产生鱼病，切断三因素相互作用的任何一环节，均可有效预防鱼病。
1．改善养殖环境做好生态防病 进入秋季，在池鱼未出现发病症状之前进行新塘转换，这是改善养殖环境的最佳方案；若条件限制，也可以把大量老化池水换掉，补充新鲜江河水来保持良好的水质，同时，早晚应多开增氧机，保证充足的溶氧；若已出现发病症状或缺少换水条件，则可使用生石灰调水、过氧化钙增氧和二氧化氯等化学方法处理，还可使用微生态制剂或中草药制剂改良。总之，须确保鱼类有良好的生态环境。
2．增强鱼类自身抗病力 秋季，池鱼同时面临上市和越冬的压力，如没有足够的免疫力是很难抵御各种病虫害入侵的，因此，秋季饲养管理，饲料除营养均衡、科学投喂外，应适当补充维生素Ｃ、Ｂ、Ｅ和微量元素等，还可适量添加保健性中草药进行病害预防。
3．消灭病原体 以防为主，做好消毒工作。做到定期、定时消毒预防，主要方法包括：严格检疫，尽量避免进种时带入病原体（包括病毒）；定期和不定期消毒，包括杀虫、杀菌，尽可能把虫、菌消灭在萌芽状态。
