芥末，辛热无毒，具有温中散寒，通利五脏、利膈开胃的作用，能利九窍、健胃消食等。芥末香辣味可刺激唾液和胃液的分泌，有开胃之功，能增强人的食欲。它还具有解毒功能，能解鱼蟹之毒，故生食三文鱼等生鲜食品经常会配上芥末。芥末呛鼻的主要成分是异硫氰酸盐。这种成分不但可预防蛀牙，而且对预防癌症、防止血管内凝块、辅助治疗哮喘等也有一定的效果。芥末还有预防高血脂、高血压、心脏病，减少血液黏稠度等功效。
在芥末中酌量添加些糖或食醋，能缓冲辣味，并使其风味更佳。

芥末具有强烈的刺激性，有胃炎或消化道溃疡的人忌食。芥末能“催人泪下”，眼睛有炎症的人不宜食用。一次不要食用太多，以免伤胃。