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肠杆菌科有一些共同特性，比如都是革兰氏阴性小杆菌，好氧或兼性厌氧，没有芽孢。
| 属 | 代表种 | 致病性 |
| 埃希氏菌属
（Escherichia） |
大肠埃希氏菌
(E.coli) |
肠道外感染，
急性腹泻 |
| 志贺氏菌属
（Shigella） |
痢疾志贺氏菌
(Sh.dysenteriae) |
细菌性痢疾 |
| 爱德华氏菌属
（Edwardsiella） |
迟纯爱德华氏菌
(E.tarda) |
蛇类等血动物的正常肠道寄居菌，偶见于健康人或腹泻者粪便内 |
| 沙门氏菌属
（Salmonella） |
伤寒沙门氏菌
(S.typhi) |
肠热症、急性肠炎、败血症 |
| 枸橼酸杆菌属
(Citrobacter) |
弗劳地氏枸橼酸杆菌
(C.freundii) |
条件致病菌，引起继发性感染 |
| 克雷伯氏菌属
(Klebsiella) |
肺炎克雷伯氏菌
(K.pneumoniae) |
肺炎，泌尿系、创伤感染
败血症等 |
| 肠杆菌属
(Enterobacter) |
产气杆菌
(E.aerogenes) |
很少引起原发性感染 |
| 哈夫尼亚菌属
(Hafnia) |
蜂窝啥夫尼亚菌
(H.alvei) |
对人无致病性 |
| 沙雷氏菌属
(Serrati) |
粘质沙雷氏菌
(S.marcescens) |
条件致病菌，引起泌尿系，
呼吸道及创伤感染 |
| 变形杆菌属
(Proteus) |
普通变形杆菌
(P.vulgaris) |
食物中毒，泌尿系、呼吸道感染
等 |
| 耶尔森氏菌属
(Yersinia) |
鼠疫耶尔森氏菌
(Y.pestis) |
鼠疫 |
| 欧文氏菌属
(Erwinia) |
草原居民欧文氏菌
(E.herbicola) |
植物寄生菌，曾从人体肠道及化脓扁桃体中分离到 |
